RNA-Seq

RNA-Seq分析流程

分析流程.png

比对和组装.png

定量和标准化.png

差异分析

差异分析.png

基因过滤.png

基因表达量数据类型

Counts.png

RPM.png

RPKM.png

FPKM:FPKM-UQ.png

TPM.png

基因表达量数据转换

  • 原始Counts数据
  • 基因长度信息（外显子长度之和）
  • 如按照protein-coding基因计算mapped reads计算，还需提供基因的分类信息

基因表达量数据转换.png